经灵芝孢子粉破壁机破壁后的灵芝孢子粉具有灵芝完全的遗传物质，因此两者的药理作用基本完全相似． 随着灵芝孢子研究的深入，其药理作用越来越受到人们的关注． 目前，国内外对灵芝孢子药理作用的研究主要集中于抗癌、免疫调节、抗氧化、神经保护、保肝、抗糖尿病等方面．
1.抗癌作用
    研究发现，灵芝孢子破壁粉的抗癌作用主要由多糖、三萜等有效成分起作用．研究发现灵芝孢子中含有16-20个碳的长链脂肪酸，能够抑制各种癌细胞的增殖;通过气相色谱检测出含16个、18个碳的脂肪酸，具有抑制癌细胞增殖的作用，发现含有19个碳的脂肪酸也具有抑制癌细胞增殖的作用，发现灵芝孢子可以通过调节肝细胞和几种相关免疫细胞来抑制人肝癌细胞的增殖，从而达到治疗肝癌的目的，在测定的 61 个 miＲNA 中，miＲ-3131 的表达最多，观察灵芝孢子的超临界CO2提取物对离体胆管癌的影响，发现其能抑制离体胆管癌的迁移，其作用主要是通过抑制 TGF-β1 诱发上皮间质转化( EMT) ，从而抑制 EMT 激活胆管癌细胞的迁移． 此外，灵芝孢子提取物对乳腺癌、前列腺癌、结肠癌等多种癌症治疗均有效果．
2.免疫调节作用
    灵芝孢子破壁粉在传统中药中用来调节免疫系统已有较长历史．观察灵芝孢子多糖对甲基硝基亚硝基胍( MNNG) 诱发胃癌大鼠的免疫性和抗氧化活性的影响发现，给予患胃癌大鼠灵芝孢子多糖后，可以降低血清和胃组织中脂质过氧化产物水平，并使胃癌所致的血清 SOD、CAT 和 GSH-Px 水平趋于正常，表明灵芝孢子多糖具有一定的免疫调节作用和抗氧化作用．实验发现，灵芝孢子可以提高诱导的小鼠淋巴细胞转化能力，增强诱导的小鼠足肿胀，增加溶血空班数等，表明灵芝孢子主要通过作用于免疫细胞增强其活性，从而直接或间接调节机体免疫功能．
3.抗氧化作用
    灵芝的抗氧化作用与多糖有关，并与多糖的单糖组成、分子量有较大关系．在对灵芝不同部位多糖的提取中发现，灵芝菌丝体中提取的多糖含量最高，灵芝孢子破壁粉中提取的多糖抗氧化活性最好，其 DPPH 清除率为0.15mg /ml，还原能力为0.69 mg /ml，均比其他部位提取的多糖抗氧化能力强．实验发现灵芝孢子的乙醇提取物表现出强烈的抗氧化活性，其体外抗氧化活性显示，灵芝孢子的乙醇提取物对 ABST、DPPH的体外清除能力均较抗坏血酸低，但相差不大．
4.神经保护作用
    灵芝孢子破壁粉对神经系统有一定的保护作用．研究发现，给大鼠服用高剂量( 8 g / kg / d) 的灵芝孢子粉可以使大鼠海马区谷胱甘肽/谷胱甘肽过氧酶( GSH /GＲ) 和丙二醛( MDA) 恢复到正常水平，保护大鼠的海马区神经细胞，从而减少阿尔茨海默病的发生．观察到，给予脊髓损伤大鼠灵芝多糖后，其能够减少组织中半胱氨酸蛋白酶-3、肿瘤坏死因子 α、过氧化物酶、丙二醛和一氧化氮的水平，从而保护脊髓损伤神经细胞．
5.保肝作用
    灵芝孢子破壁粉具有护肝、保肝作用．研究发现，灵芝孢子破壁粉对镉( Cd) 引起的肝损伤小鼠具有保护作用，其作用主要是减少血清中ALT、AST 含量和肝脏指数，改善组织的病理状态．观察到灵芝孢子对 CCl4 肝损伤小鼠的纤维化保护作用，经灵芝孢子治疗后可显著降低小鼠血清中 ALT 和 AST 含量，升高肝组织中 SOD 含量，降低 MDA 含量，组织病理学显示，灵芝孢子可使肝纤维化程度降低，且肝组织中 MMP-9 蛋白表达显著降低，提示灵芝孢子可能通过调节 MMP-9 蛋白来改善肝纤维化．
6.抗糖尿作用
    在灵芝孢子破壁粉的抗糖尿作用方面，研究发现，灵芝中的成分，如多糖、三萜、蛋白聚糖和蛋白质等均具有抗糖尿病作用，灵芝多糖和蛋白聚糖的FYGL 组份具有降低总胆固醇、甘油三酯和体内低密度脂蛋白的水平，这可能有助于预防糖尿病并发症的发生，如动脉粥样硬化和高脂血症．研究发现，灵芝多糖中的 F31 组份具有抗糖尿病的潜力，其作用机制可能是通过激活 AMPK 通路从而减少肝葡萄糖调节酶 mＲNA 的水平、改善胰岛素抵抗和降低附睾的脂肪率有关，因此，其可以用来预防和治疗肥胖和 2 型糖尿病．